Pilar Aguilera Sepúlveda es graduada en Biología por la Universidad Autónoma de Madrid. Posteriormente realizó un Máster en Biotecnología en la misma Universidad donde se especializó en la rama sanitaria. Tras trabajar tres años en el Instituto de Salud Carlos III (Madrid) con una beca de la Fundación del Hospital 12 de Octubre, en 2016 se incorporó al Centro de Investigación en Sanidad Animal (CISA), perteneciente al Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA).
Allí comenzó a trabajar en el diagnóstico y la epidemiología molecular de flavivirus zoonóticos dentro del grupo de Enfermedades Emergentes y Transfronterizas, colaborando en diferentes proyectos. Desde 2018 realiza su tesis doctoral centrada en el análisis de nuevos brotes de encefalitis producidos por el virus West Nile en aves y caballos en España y su expansión geográfica.
